Babilon qalasının fəthindən və Misirin ilk İslam paytaxtı kimi Fustat şəhərinin qurulmasından sonra vahid mənəvi və inzibati mərkəzə ehtiyac yarandı. Hicri 20-ci ilin 24 Ramazanında (Noyabr, 641) Fustatda Əmr bin əl-As məscidinin inşasına başlanıldı. Bu məkan təkcə ibadət yeri deyil, həm də Əzhərdən əsrlər öncə fəaliyyət göstərən bir "universitet", məhkəmələrin qurulduğu, məşvərətlərin keçirildiyi və yeni qurulan dövlətin işlərinin idarə edildiyi mərkəz idi.