Coğrafi adlandırmada bəzən elmi xüsusiyyətlərlə adlar üst-üstə düşmür. Məsələn, Meksika körfəzi suyunun fiziki-kimyəvi tərkibinə və zəngin üzvi aləminə görə əslində dəniz hesab olunmalıdır. Əksinə, Qırmızı dəniz öz xüsusiyyətlərinə görə körfəz adlandırılmağa daha uyğundur. Bu cür fərqliliklər körfəzlərin xarici sərhədlərinin şərti olmasından irəli gəlir.